Panx1基因在非小细胞肺癌中的表达及生物学功能生物信息分析

摘要：

目的 探讨泛连接蛋白1基因在人非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中表达和预后关系.方法 首先在癌症基因组图谱数据库(TCGA)中对Panx1基因差异表达情况进行分析.在STRING数据库中构建Panx1基因编码蛋白相互作用网络.对Panx1基因功能进行富集和注释,并分析相关信号通路.根据Panx1基因在患者癌组织中的表达水平分为高表达和低表达组,分析高低表达组生存期差异有无统计学意义.同时选取NSCLC患者61例,采用免疫组织化学法检测患者手术标本中癌和癌旁正常组织中Panx1表达水平,分析比较Panx1表达与患者临床病理特征及预后的关系.结果 Panx1基因在NSCLC患者癌组织中表达水平明显高于正常肺组织;Panx1基因在不同分期NSCLC患者中差异存在统计学意义(F=3.300,P=0.020).Panx1基因编码产物主要参与了多器官发育、细胞间交流和对刺激的反应生物学过程;信号通路主要富集于细胞增殖信号通路、凋亡信号通路和钙离子相关信号通路.PAFAH1 B2与Panx1基因表达水平呈正相关(r=0.650,P=0.023),而C22orf32与Panx1基因表达呈负相关(r=-0.340,P=0.032).Panx1基因高表达与NSCLC患者总生存(OR)相关,高表达组OS低于低表达组(HR=1.400,P=0.001),而Panx1基因表达水平与患者无疾病进展生存(DFS)无明显相关性.亚组分析显示,Panx1基因表达与肺腺癌OS生存有关(HR=1.400,P=0.017).Panx1表达水平与NSCLC患者TNM分期(x2 =7.244,P=0.007)和纵隔淋巴结转移有关(x2 =7.582,P=0.006).结论 Panx1基因在非小细胞肺癌患者肿瘤组织中表达水平上调,高表达与患者的总生存期较短有关.

关键词：非小细胞肺癌、Panx1基因、生存分析、信号通路

所属期刊栏目：18

分类号：R734.2;R393(肿瘤学)

资助基金：陕西省高等学校重点科研项目计划18A330007

在线出版日期：2020-05-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：856-859