hsa-miR-145-5p在胰腺癌中的表达及生物信息学分析

摘要：

目的 研究hsa-miR-145-5p在胰腺癌患者及正常人血浆中的表达模式,探究hsa-miR-145-5p作为胰腺癌诊断标记物的可行性.进一步阐明其在胰腺癌的发生发展过程中可能的调控机制.方法 采用生物信息学方法进行hsa-miR-145-5p的靶基因预测及功能分析,选择miRanda、TargetScan和RNAhybrid三种软件预测hsa-miR-145-5p的靶基因并结合现有数据库筛选有实验数据支持的靶基因,进一步进行GO功能富集分析,KEGG Pathway富集分析和蛋白互作分析,研究靶基因功能.qPCR验证胰腺癌患者及正常对照组血浆中hsa-miR-145-5p表达.结果 hsa-miR-145-5p序列在各物种间高度保守;预测其靶基因共得到8 679个,且有实验数据支持靶基因有1 408个;有实验数据支持的靶基因GO富集分析主要显著富集于胞内运输、基因表达调控、细胞内信号传导、细胞生长调控、能量代谢等生物学过程和功能上(FDR ＜0.01).KEGG Pathway富集分析靶基因显著富集于p53信号通路、ErbB信号通路、MAPK信号通路、慢性骨髓白血病、膀胱癌、胶质瘤、前列腺癌、胰腺癌等(P＜0.01),表明hsa-miR-145-5p在胰腺癌中有重要的调控作用.相较于正常组,患病组hsa-miR-145-5p表达下调.结论 hsa-miR-145-5p调控多个肿瘤发生相关的基因,在胰腺癌发生相关的生物学过程中具有重要的调控功能,为胰腺癌miR-NA标记物的研究提供了线索.

关键词：hsa-miR-145-5p、胰腺癌、生物信息学、靶基因、qPCR、预后

所属期刊栏目：15

分类号：R735.9(肿瘤学)

资助基金：浙江省医药卫生科研基金2017KY251;浙江省中医药管理局基金2016ZB026

在线出版日期：2017-05-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：755-758