10.3969/j.issn.1000-1700.2020.04.009
蚕豆萎蔫病毒2号辽宁藜分离物的鉴定
2016年6月在辽宁省沈阳市采集到表现为疑似蚕豆萎蔫病毒2号所致皱缩症状的藜病叶样品.选取明显病症样品送华大基因进行RNA提取和质量检测,得到OD260/280为2.09,OD260/230为1.85,RIN值为7以及28S/18S为1.3的合格样品.利用该RNA样品构建了去除rRNA的转录组库,经BGISEQ-500平台测序得到11.83 Gb数据.数据经过CLC Genomics Workbench(CLC bio v10.0,Aarhus,Denmark)软件过滤和拼接后获得长度为5945和3550的2个contigs,其经BLASTn和BLASTx比对显示与BBWV2的高度同源.基于此contigs序列,设计7对引物对病毒样品进行RT-PCR扩增,得到5891个核苷酸的RNA1序列(GenBank登录号为MN786954),3549个核苷酸的RNA2序列(GenBank登录号为MN786955).基于该病毒cp基因的氨基酸序列进行同源性分析,发现该病毒与韩国益母草分离物BBWV2-[SK:Leonurus sibiricus](KM076649)同源性最高,为96.5％.根据Fabavirus的分类标准,认为该病毒是BBWV2的辽宁分离物.这是国际上首次报道藜科植物感染BBWV2.
Fabavirus、蚕豆萎蔫病毒2号、藜、分子特征
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S432.1(病虫害及其防治)
辽宁省自然科学基金项目20180550863
2020-11-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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446-453
