玉米大斑病菌全基因组候选效应分子的预测和分析

摘要：

大斑病是一种世界性玉米叶部病害,可造成玉米产量严重降低,其致病菌大斑刚毛座腔菌(Setosphaeria turcica)可在叶片形成坏死斑,影响玉米品质并造成严重经济损失.效应分子在植物病原真菌对植物侵染过程中发挥着重要作用.根据玉米大斑病菌Et28A菌株全基因组信息,利用SignalP、TMHMM、Protcomp、big-PI Predictor和TargetP生物信息学软件和预测程序对玉米大斑病菌中11698条蛋白序列进行候选效应分子预测,再通过对上述蛋白半胱氨酸含量、信号肽长度及冗余性分析,获得60个符合条件的候选效应分子,其中大部分为功能未知的假定蛋白.利用生物信息学方法预测出玉米大斑病菌的候选效应分子,为进一步研究效应分子在病原菌与玉米互作中的作用奠定了基础,并为其他病原菌效应分子的预测及分析提供了参考.

关键词：玉米大斑病菌、候选效应分子、全基因组、生物信息学

所属期刊栏目：48

分类号：S432.1(病虫害及其防治)

资助基金：国家自然科学基金项目31271992

在线出版日期：2017-04-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：15-20