基于可变剪接的头颈鳞癌亚型与肿瘤微环境的关系

摘要：

目的:利用癌症基因组图谱的头颈鳞癌数据探讨可变剪接与肿瘤微环境的关系.方法:从UCSC-Xena、TIMER2.0、Spliceseq网站分别下载TCGA头颈鳞癌的转录组和临床数据、免疫浸润数据以及剪接百分比数据.根据剪接数据对肿瘤样本进行分型,对各型进行通路富集及肿瘤微环境分析.结果:共纳入 485 例肿瘤和 41 例正常样本,涉及剪接事件 6720 个,基因 3330 个.一致性聚类将头颈鳞癌分成 4 个亚型.亚型间的预后及部分临床特征差异显著.4 个亚型间有不同的微环境特征和检查点基因特征.结论:头颈鳞癌的可变剪接与临床表型及肿瘤微环境密切相关.基于可变剪接的头颈鳞癌分型有一定的免疫靶点选择和研究的提示作用.

关键词：可变剪接、头颈鳞癌、肿瘤微环境、免疫检查点

所属期刊栏目：39

分类号：R739.8(肿瘤学)

资助基金：湖北省自然科学基金2019CFB450

在线出版日期：2023-05-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：203-209