口腔鳞癌中缺氧基因相关预后模型的构建与验证

摘要：

目的:通过生物信息学筛选并建立与口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者预后相关的缺氧基因预后模型.方法:通过癌症基因组图谱(TCGA)和GEO数据库下载OSCC患者的mRNA表达谱、临床数据和预后信息;通过蛋白互作网络(PPI)、Cox回归分析筛选和建立缺氧基因预后模型;生存分析(Kaplan-Meier,K-M)和受试者工作特征曲线(ROC)检验预后模型的准确性,单因素和多因素Cox回归评估模型作为独立预后因素的可行性;免疫相关性分析筛选差异表达的免疫检查点基因.结果:通过Cox回归分析构建了基于SLC2A3、GPI、PGK1 三个缺氧基因的预后模型,将OSCC患者分为高风险组(n=173)、低风险组(n=172).TCGA数据库中K-M生存曲线显示高风险组患者的生存率(OS)明显低于低风险组患者(P<0.001),患者1、3、5 年ROC曲线下面积分别为 0.626,0.677 和 0.713;GEO数据库中K-M生存曲线显示高风险组患者的生存率(OS)明显低于低风险组患者(P=0.023),患者 1、3、5 年ROC曲线下面积分别为 0.683、0.705 和 0.690;单因素和多因素Cox回归分析显示,该预后模型可作为评估OSCC患者生存率的独立预后因素(P<0.01);免疫相关性分析表明CD276 等免疫检查点分子在不同风险组中表达具有显著性差异(P<0.001).结论:OSCC缺氧基因相关预后模型具有良好的预测性能,可为OSCC患者进行精准分组和靶向治疗提供参考.

关键词：口腔鳞状细胞癌、缺氧基因、预后模型、免疫治疗

所属期刊栏目：39

分类号：R739.8(肿瘤学)

资助基金：上海市青年科技扬帆计划20YF1423300

在线出版日期：2023-05-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：198-202