牙囊干细胞成骨分化基因调控网络的生物信息学分析

摘要：

目的：应用生物信息学分析牙囊干细胞（DFSCs）成骨分化过程中基因调控网络。方法：从 GEO Datasets 数据库获取在 DFSCs 成骨分化过程中差异表达的基因。应用 DAVID 和 GeneMANIA 数据库对这些基因的关系进行分析。结果：从 GEO Datasets 数据库获得了大量 DFSCs 成骨分化过程中差异表达的基因，对差异表达明显（P ＜0．05）的289个基因进行分析，富集到“细胞分化”、“细胞增殖”、“骨骼系统发育”、“钙信号通路”等基因子集。其中 ALPL、CTSK、TUFT1、TGFBR2、FHL2、ROR2、STC1、POSTN，ZBTB16、FRZB、PRELP、IGFBP5等12个基因被富集在“骨骼系统发育”子集，这12个基因通过共表达、共定位、遗传学相互作用等彼此关联并与其它信号通路相联系。结论：DFSCs 成骨分化中许多差异表达的基因间存在相互作用的分子网路。需要从 WNT、TGFbeta、MAPK 等信号通路、同源盒转录因子及成骨分化标记物基因的整体关系上来认识 DF-SCs 成骨分化。

关键词：牙囊干细胞、成骨分化、调控网络、生物信息学分析

所属期刊栏目：32

分类号：Q786(基因工程（遗传工程）)

在线出版日期：2016-08-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：480-484