舌鳞癌中高醛脱氢酶活性细胞相关基因的生物信息学分析

摘要：

目的:构建舌鳞癌Tca8113细胞中高醛脱氢酶活性(high aldehyde dehydrogenase activity,ALDHhigh)细胞特异性表达基因cDNA文库并进行相应的生物信息学分析.方法:应用抑制性消减杂交(SSH)技术,以ALDHhigh细胞RNA为测试方、低醛脱氢酶活性(ALDHlow)细胞RNA为驱动方,构建文库；应用BLAST、Gene Set Analysis Toolkit V2等软件进行生物信息学分析.结果:随机挑选20个集落进行PCR分析,克隆片段均匀分布在200 bp～ 700 bp,无假阳性克隆,成功构建文库；对120个克隆测序并进行BLAST分析,得到27个差异表达基因；功能聚类发现部分与细胞增殖、生长繁殖、再生等生物行为相关.结论:成功构建的ALDHhigh细胞特异性表达基因cDNA文库,为下一步找出ALDHhigh干细胞特性相关基因提供帮助.

关键词：人舌鳞癌Tca8113、抑制性消减杂交技术、肿瘤干细胞、醛脱氢酶、生物信息学

所属期刊栏目：29

分类号：R739.8(肿瘤学)

资助基金：重庆市卫生局科研基金资助课题2008-2-232、231

在线出版日期：2013-07-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：375-379