鸡(土从)菌基因组测序和比较基因组分析

摘要：

对采集自四川省内江市东兴区高桥村灌木林的鸡(土从)菌(Termitomyces albuminosus)进行基因组测序、组装、基因功能注释、碳水化合物酶(carbohydrate-active enzyme,CAZy)预测、进化树构建、同源序列比对及简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记开发和PCR扩增验证的研究工作.结果表明:鸡(土从)菌全基因组共存在1.71×103个蛋白质编码基因,平均长度为1.65×103bp;CAZy功能注释聚类分析表明,黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)、内华达古白蚁(Zootermopsis nevadensis)、面包酵母(Saccharomyces cerevisiae)和裂体吸虫(Schistosoma mansoni)聚类到同一大组,鸡(土从)菌与其他物种聚类到另一大组,且与刺芹侧耳(Pleurotus eryngii)和糙皮侧耳(P.ostreatus)聚类到更小分组;进化树分析表明,蚁巢伞属真菌与常见的栽培食用菌之间存在一定的进化距离,与金针菇(Flammulina velutipes)、猴头菌(Hericium erinaceus)和香菇(Lentinula edodes)的进化距离较近;采用SSR标记对收集的鸡(土从)菌进行分析,发现一地域分布的鸡(土从)菌在遗传上存在较高的相似性.

关键词：鸡(土从)菌、白蚁、基因组组装、比较基因组、简单重复序列

所属期刊栏目：29

分类号：Q933;Q78;R378.5

资助基金：内江师范学院大学生创新创业训练计划项目X2021089

在线出版日期：2022-12-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：1-13