高通量测序研究鸡(从)菌菌圃及其近周土壤细菌群落结构

摘要：

对鸡(从)菌(Termitomyces sp.)生长的表层土(St,5 cm)、中层土(Sm,5 cm)、里层土(Si,5 cm)以及巢腔壁(Cw)和菌圃(Fc)样本进行细菌16 SrDNA高通量测序,分析样本间细菌群落结构的变化.共获得567379条质控序列,这些序列按照相似度大于97％为一类的标准,被归为3202个操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs),这些OTUs又被分为40个门、96个纲、194个目、352个科、621个属.在门水平,变形杆菌(Proteobacteria)等11个门在菌圃近周土壤中的相对丰度都大于1％,总占比大于97％;在巢腔壁和菌圃中也均为主体菌.在属水平,305个属为样本共有,其中Burkholderia-ParaBurkholderia在巢腔壁和菌圃中占绝对优势,相对丰度分别达43.89％和37.58％;BradyRhizobium仅在菌圃中相对丰度(24.82％)较高;Acidobacteria_c_norank则是近周土壤中的优势属,相对丰度范围12.55％～13.41％.在OTU水平,OTU 2694、OTU 2822、OTU 2881在巢腔壁和菌圃中相对丰度(6.49％、3.73％、4.98％)较高.总体上讲,3个土壤层(St、Sm、Si)中的细菌类群相对丰度相近,巢腔壁、菌圃与土壤层相比差异较大,相对丰度较高的细菌类群对维持菌圃和巢腔壁微生态系统可能发挥重要作用.

关键词：鸡(从)菌、菌圃、土壤、高通量测序、细菌群落结构

所属期刊栏目：29

分类号：Q938.1;X172;S541+.9

资助基金：广东省自然科学基金;贵州省科技计划项目

在线出版日期：2022-08-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：17-27