10.16488/j.cnki.1005-9873.2021.06.001
金针菇Zn2Cys6型锌指转录因子家族分析及其对蓝光的响应
利用已完成的金针菇(Flammulina filiformis)基因组数据,通过构建HMM模型、鉴定氨基酸序列保守结构域得到金针菇基因组中87个Zn2Cys6型锌指转录因子家族成员(命名为FfZCP01~FfZCP87).通过分析锌簇结构域,将87个家族成员分为13个类型(A~M),并且发现不同类型的家族成员虽然具有相似的基序模式,但氨基酸保守程度不同;进化水平分析显示A~D、F类型内的成员间亲缘关系较近.选取8个FfZCP家族主要类型的典型基因进行实时荧光定量PCR,结果发现FfZCP09、FfZCP28、FfZCP32、FfZCP60、FfZCP62基因在蓝光照射下表达量显著下调,推测其可能以负调控方式参与金针菇对蓝光照射的响应过程,结果为进一步揭示蓝光对金针菇的作用机制提供参考.
金针菇;Zn2Cys6;转录因子家族;蓝光照射
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国家自然科学基金青年科学基金;福建省自然科学基金;福建农林大学杰出青年科研人才计划项目;福建农林大学科技创新专项基金;福建省种业创新与产业化工程项目
2021-12-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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