斑玉蕈栽培菌株遗传变异与生长速率GWAS分析

摘要：

以38份斑玉蕈(Hypsizygus marmoreus)种质资源为研究对象,采用全基因组重测序获得供试菌株的SNP(single nucleotide polymorphism)数据,结合在不同温度(10、15、20、25、30℃)下的菌丝生长速率测定结果,开展全基因组关联分析(genome wide association study,GWAS).结果 表明:供试群体分为4大类群;在实验范围内,20、25℃为斑玉蕈适宜生长温度;GWAS分析显示20、25℃分别存在10、14个与生长速率显著关联的SNP位点,其中1个属于潜在功能性SNP位点.

关键词：斑玉蕈、遗传变异、生长速率、SNP、GWAS

所属期刊栏目：28

资助基金：上海市现代农业产业技术体系项目[沪农科产字2021第9号

在线出版日期：2021-04-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：18-25