草菇多糖单加氧酶基因Vv-lpmo1的序列分析及其表达规律
依据草菇(Volvariella volvacea)基因组和转录组数据,采用ZOOM软件将转录组Reads定位到基因组的分析方法,从草菇中鉴定了一个多糖单加氧酶基因Vv-lpmo1,对其进行生物信息学分析,并对其高效诱导物进行筛选,采用定量PCR方法研究其在降解稻草时表达量的变化规律.结果表明:草菇Vv-lpmo1基因DNA序列长1432 bp,有9个内含子,预测编码305个氨基酸的蛋白质;生物信息学分析表明该蛋白质有分泌信号肽,且含有两个完整的保守结构域:N端的glycoside hydrolase family 61 (GH61)结构域和C端的cellulose-binding domain(CBD)结构域.通过对葡萄糖、无碳源(饥饿诱导)、微晶纤维素、滤纸、稻草和木屑6种不同基质诱导草菇菌丝的定量PCR,结果筛选出稻草对Vv-lpmo1基因有最强的诱导作用.进一步研究稻草诱导不同时间的变化过程中,该基因的表达规律为0～4 h先下调;4～12 h恢复到初始水平;12 h以后开始迅速上调并维持较高水平.本研究表明草菇多糖单加氧酶基因Vv-lpmo1属于诱导表达型基因,可能在草菇降解稻草基质中起着重要作用.
草菇、多糖单加氧酶基因、定量PCR、表达量
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S56;S81
国家“973项目”2014CB138302;国家现代农业产业技术体系建设专项资金CARS24;福建农林大学优秀博士学位论文资助基金YB2013007的部分研究内容
2015-07-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
8-14,封3
