10.3969/j.issn.1005-9873.2014.01.001
金针菇菌丝与原基差异表达基因分析
以金针菇(Flammulina velutipes)1123菌株的单孢 W23基因组为参考完成其菌丝和原基转录组测序与数据分析,研究两样本间差异基因,并对差异基因进行 GO功能和 KEGG Pathway 显著性富集分析。结果表明:两个样本中共有显著性差异表达的基因3310个,其中在原基中上调、下调的基因数分别为1686、1624个,只在原基中表达的基因有26个。GO功能分析结果表明,在原基中膜封闭腔、内膜系统、细胞器腔、核糖核蛋白复合体、翻译调节器、发育过程、免疫系统过程、多细胞生物过程这8个GO基本单元中的差异基因全部呈现上调表达。Pathway 功能富集分析结果表明,核糖体与DNA复制中的差异基因全部呈现上调表达,糖酵解途径中从D-葡萄糖转化成丙酮酸过程相关的11个差异基因全部呈下调表达,磷酸戊糖途径中相关的13个差异基因中有11个基因呈下调表达。
原基、差异基因表达、GO功能、Pathway分析
S64;R61
国家现代农业产业技术体系建设专项资金CARS24;973计划项目2014CB138302基金资助
2014-07-05(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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