Hsa-miR-26a靶基因的预测及其在肺发育中的应用

摘要：

目的 对hsa-miR-26a进行靶基因预测及相关生物信息学分析,为hsa-miR-26a靶基因的实验验证提供数据支持,并为深入研究hsa-miR-26a在肺发育中的生物学功能及调控机制奠定基础和提供理论依据.方法 应用PubMed、Google等信息搜索工具查找miR-26a的所有研究；应用miRBase获取hsa-miR-26a的序列,并分析其序列保守性；利用miRNA靶标基因数据库miRGen2.0进行hsa-miR-26a的靶基因预测,选取PicTar和TargetScanS的交集并合并DIANA LAB-TarBase6.0数据库的已验证靶标对靶基因进行功能富集分析(GO-analy-sis)及信号转导通路分析.结果 已有研究提示hsa-miR-26a在肿瘤、细胞分化、器官发育、免疫系统等生物学过程具有重要作用.hsa-miR-26a在多物种间高度保守.miR-26a调控的靶基因生物学功能主要包括转录调控、蛋白质修饰、细胞增殖、凋亡、分化等基本生物学过程和蛋白激酶活性等分子功能上,靶基因存在于细胞各个组分中,包括细胞膜、细胞质、细胞核中；信号转导通路显著富集于Wnt信号通路,丝裂原活化蛋白激酶信号通路,转化生长因子-β信号通路,p53信号通路,细胞周期、黏附功能等信号通路以及前列腺癌、小细胞肺癌、直肠癌、肾癌、神经胶质瘤5个疾病通路中(P均＜0.05).结论 通过对hsa-miR-26a靶基因的生物信息学分析,为研究hsa-miR-26a在肺发育中的作用提供了功能与机制的线索.

关键词：miR-26a、靶基因、生物信息学、肺发育

所属期刊栏目：28

分类号：R730.264;S811.6;R285.5

资助基金：国家自然科学基金81270725

在线出版日期：2019-01-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：127-130