宫颈癌组织中环状RNA差异表达谱分析及临床意义

摘要：

目的:分析环状RNA(circRNA)在宫颈癌组织及癌旁正常组织中的差异表达谱,探讨circRNA与宫颈癌发病机制及预后的关系.方法:收集我院2014年7-10月确诊为宫颈癌并行手术治疗的10例患者的癌组织及对应癌旁正常组织,采用基因芯片技术筛选两组样本间差异表达circRNA,随机选择差异表达circRNAs行实时荧光定量PCR检测(RT-qPCR)验证测序结果,选择RT-qPCR验证结果中表达差异最大的circRNA,结合癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析其相对表达量与宫颈癌患者术后生存时间的关系,通过生物信息学方法分析差异表达circRNA宿主基因的生物学功能及信号通路.结果:宫颈癌组织及配对癌旁正常组织中发现DE circRNA有25749个(差异倍数≥2,P<0.05),其中表达上调的有12806个,表达下调有12943个;选取14个显著差异表达的circRNA(差异倍数≥3,P<0.05),RT-qPCR验证显示78.6％(11/14)与芯片结果一致;RT-qPCR验证结果显示hsa_circ_0008517在宫颈癌组织中显著低表达,且hsa_circ_0008517低表达组的中位生存时间低于高表达组,差异有统计学意义(P<0.05);GO富集分析显示异常表达circRNA参与细胞增殖、分化、信号转导等多种生物学过程和信号通路.结论:circRNA在宫颈癌组织中差异表达,与宫颈癌患者的预后密切相关,为宫颈癌的临床诊疗及评估预后提供新方向.

关键词：宫颈癌、环状RNA、非编码RNA、基因表达谱、芯片

所属期刊栏目：30

分类号：R737.33(肿瘤学)

资助基金：河南省科技攻关项目202102310064

在线出版日期：2022-06-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1640-1644