10.3969/j.issn.1672-4992.2021.16.011
肺腺癌中关键lncRNA的表达及免疫相关分析
目的:通过鉴定与肺腺癌(LUAD)预后相关的长非编码RNA(lncRNA),研究LUAD的发生机制及其预后意义,确定与LUAD预后相关的敏感性生物标志物,并对其进行免疫途径相关性分析.方法:从肿瘤基因组图谱数据库(TCGA)中获取与LUAD相关的数据,通过单因素Cox回归分析及套索算法(LASSO)筛选lncRNA,使用多因素Cox回归进行预后风险评分分析,建立预后风险模型,用计算曲线下面积(AUC)和Kaplan-Meier(K-M)生存分析方法评价模型的稳健性和准确性.利用K-M生存分析方法确定与生存状态相关的潜在生物标志物,并通过ImmLnc平台对其进行免疫途径相关性研究.结果:从49个与生存相关的lncRNAs中确定了12个预后相关生物标志物,通过K-M生存分析,MIR34AHG和PRKCA-AS1被确定为与预后相关的生物标志物(P<0.05).模型的3年和5年生存率的AUC分别为0.82和0.846.与MIR34AHG相关的免疫途径分别为"细胞因子受体"(P<0.05),"抗原处理和提呈"(P<0.05),与PRKCA-AS1相关的免疫途径为"抗原处理和提呈"(P<0.05).结论:通过对生物信息大数据的分析,我们确定了两个关键lncRNAs及其相关的免疫途径,为LUAD的预后评估提供了新的生物标志物.
肺腺癌;长非编码RNA;肿瘤基因组图谱;免疫途径
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R734.2(肿瘤学)
北京市科学技术委员会计划资助项目编号:D161100005116001
2021-08-16(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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