人食管鳞状细胞癌中miR-424的差异表达及生物信息学分析

摘要：

目的:探讨hsa-miR-424(miR-424)在人食管鳞状细胞癌发生发展机制中的作用,并对其生物学特征及功能进行预测总结分析,为最终研究miR-424的功能提供有利的线索.方法:通过实时荧光定量PCR方法,检测食管鳞状细胞癌患者石蜡标本和癌旁组织,以及人食管鳞状细胞癌细胞株kyse520、kyse410和正常人食管上皮细胞系Het-1 A中miR-424相对表达水平.应用MIRDB、miRanda、Target Scan三种在线工具预测miR-424的靶基因,取三者预测结果的交集,并结合DIANALAB-TarBase7.0数据库和miRTarBase数据库两个已经实验证实的基因数据库,确定miR-424的靶基因范围.最后通过使用在线数据库metascape对has-miR-424预测的靶基因集合进行基于GO、KEGG数据库的功能注释分类和通路富集分析.结果:miR-424在食管癌细胞系kyse520和kyse410中的表达显著高于正常食管上皮细胞系Het-1A的表达(P<0.01).与对应的癌旁组织相比较,鳞癌组织中miR-424的表达均显著增高,其中,约77.8％(56/72)的患者癌组织中miR-424的表达较癌旁组织上调了超过50％.miR-424在物种进化上具有高度保守性,其靶基因功能主要集中在调控细胞生长、增殖和正负向调控细胞凋亡;参与蛋白质脱磷酸和泛素化,组蛋白修饰和甲基化,DNA损伤修复等生物学过程(P<0.01).主要参与的信号通路有p53信号通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路和酪氨酸激酶信号通路(P<0.01).结论:miR-424在食管鳞状细胞癌中是高表达状态,提示miR-424可以作为癌症促进子参与食管癌的发生发展.

关键词：食管鳞状细胞癌、hsa-miR-424、生物信息学

所属期刊栏目：28

分类号：R735.1(肿瘤学)

资助基金：陕西省重点研发计划编号:2017SF-184

在线出版日期：2020-04-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：557-562