基质金属蛋白酶1在头颈部鳞癌中的表达水平及微RNA调节的生物信息学研究

摘要：

目的 分析头颈部鳞癌(含皮肤鳞癌)中基质金属蛋白酶1(MMP1)和微RNA(miRNA)表达水平并筛选目标miRNA.方法 下载GEO相关数据,比较头颈部鳞癌MMP1表达水平.利用miRanda、TargetScan7.2和miRDB软件在线预测miRNA,进一步与miRTarBase结果做比对,获得目标miRNA并进行验证.分析目标miRNA与MMP1的相互关系.结果 与正常组织或不典型增生病变相比,MMP1在头颈部鳞癌(含皮肤鳞癌)组织中高表达,MMP1可参与癌变整个发展过程,并促进HNSCC转移;在线预测共获得3个目标miRNAs:miR-202、miR-326和miR-488,其中miR-202 mirSVR评分最高.相反,与正常组织相比,miR-202头颈部鳞癌(含皮肤鳞癌)中,miR-202表达水平明显低于正常组织,从正常皮肤-KIN1/2-KIN3-cSCC,miR-202可参与疾病整个发展过程.相关分析显示miR-202表达与MMP1呈负相关(r=-0.14,P＜0.05).结论 MMP1在头颈部鳞癌(含皮肤鳞癌)组织中高表达,miR-202低表达,miR-202可能是调节MMP1的真实miRNA,二者呈负相关.

关键词：基质金属蛋白酶1、微RNAs、头颈鳞癌、皮肤肿瘤、计算生物学

所属期刊栏目：52

分类号：R739.5;P129;R318.04

资助基金：天津市北辰区科技计划项目SHGY-2020040

在线出版日期：2023-10-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1043-1049