儿童恶性疟疾患者外周血基因表达谱的改变及生物信息学特征分析

摘要：

目的 分析儿童恶性疟疾患者外周血基因表达谱、关键蛋白的改变及其生理学功能,为疟疾防治提供新依据.方法 从基因芯片公共数据库GEO中获得疟疾惠儿外周血基因芯片数据,共5例疟疾患儿,均依据WHO疟疾诊断标准明确诊断,采用自体匹配设计,每位患儿分别在轻症、重症疟疾时采集外周血;分析不同病情患儿的基因表达谱、蛋白相互作用网络、分子生物学过程、基因功能,寻找疟疾惠儿病情进展相关的关键基因.结果 623个(1.93％)差异表达基因可鉴别区分轻症、重症患儿;OAS2,OAS3,IFIT3和USP18基因是差异基因蛋白-蛋白交互作用网络(protein-protein interac-tions,PPI)中子网络的核心节点;差异表达基因主要参与机体的免疫防御、免疫应答、对外部刺激应答、干扰素-1型通路的活化等生物学功能.结论 疟疾患儿病情的进展可能受OAS2,OAS3,IFIT3和USP18等基因的调控,儿童的免疫防御能力下降与病情进展具有重要的关系.

关键词：疟原虫、疟疾、差异表达基因、生物信息学

所属期刊栏目：32

分类号：R725.3;Q786(儿科学)

资助基金：陕西中医药大学校内基金资助基金2015QN05

在线出版日期：2017-09-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：36-39