镇江地区儿童群体博卡病毒感染情况及基因组遗传特征

摘要：

目的 了解镇江地区呼吸道和胃肠道疾病患儿博卡病毒(HBoV)流行状况,并通过对代表毒株的全基因组测序了解博卡病毒遗传特征.方法 收集2010年1月～2011年12月期间镇江地区156份呼吸道疾病患儿鼻咽分泌物样品和310份急性胃肠炎患儿粪便样品,采用PCR方法检测HBoV基因;选取3株镇江地区HBoV代表毒株,测序获取全基因组序列,采用CLUSTAL和MEGA4.0等软件进行序列同源性及系统发育分析.结果 HBoV在鼻咽分泌物样品中的检出率为2.56％,在粪便样品检出率为3.55％;HBoV基因序列均与GenBank中提交的HBoV-1型毒株高度同源(＞95％),且与上海地区的7株HBoV-1和重庆地区的3株HBoV-1同源性最高;系统进化分析结果显示,3株HBoV-1代表株聚类在三个不同的类群中,其中ZJ92与来自中国香港的HBoV毒株HK24及上海的HBoV毒株SH8遗传关系最近,ZJ42与来自泰国的毒株CU25遗传关系最近,而ZJ68与来自上海的R3080522001和SH1亲缘关系最近.结论 HBoV-1为镇江地区HBoV主要流行基因型;系统进化分析显示镇江地区的HBoV-1毒株与重庆和上海的毒株有共同的分子起源.

关键词：人博卡病毒、分子流行病学、系统进化分析、基因型

所属期刊栏目：30

分类号：R373.1;Q786(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2016-03-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：67-71