高分辨熔解技术在疾病关联SNP验证检测中的应用

摘要：

目的 探讨高分辨熔解(high resolution melting,HRM)技术的常规化检测流程以及实验设计策略和具体操作要点.方法 以疾病关联SNP单位点IL1B-31和双位点IL6-597/-572的检测为例,分别从核酸提取,引物设计、验证和有效性评价以及酶系统和HRM染料的选择与匹配等方面进行最优策略与流程的探索.结果成功建立了单位点IL1B-31和双位点IL6-597/-572的PCR-HRM检测方法并得到验证.柱提基因组DNA模板、特异高效HRM引物和应用热启动酶是PCR-HRM检测方法成功建立的关键,尤其是Beacon designer,uMelt和mfold等工具软件的应用.结论 HRM技术是一种适合疾病关联SNP验证和临床分子诊断的高通量、低成本、易操作、闭管均相检测新方法.

关键词：高分辨熔解、单核苷酸多态性(SNP)、基因分型、荧光染料

所属期刊栏目：27

分类号：R394-3

资助基金：教育部春晖计划项目Z2010085;甘肃省科技支撑项目090NKCA094;甘肃省消化系肿瘤重点实验室开放课题基金和兰州大学中央高校基本科研业务费专项lzujbky-2011-t03-01

在线出版日期：2012-10-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：19-22