通过生物信息学方法筛选新的非酒精性脂肪性肝炎关键基因

摘要：

目的 通过生物信息学方法筛选新的非酒精性脂肪性肝炎(non-alcoholic steatohepatitis,NASH)关键基因,从而为NASH的诊断和治疗以及科研提供新的思路与方法.方法 通过GEO(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库获取关于NASH的基因表达芯片数据,进一步通过GEO2R在线分析工具分析手段获得NASH和正常组织的差异化表达基因(differenti-ally expressed genes,DEGs).随后,对这些DEGs进行功能富集分析,同时借助于蛋白-蛋白相互作用网络图分析(protein-pro-tein interaction,PPI)去寻找NASH发生和发展的潜在分子作用机制.结果 获得GSE17470芯片,514个DEGs以及11个关键基因(VEGFA、FOS、CAT、ALDH7A1、ALDH1B1、ALDH1A1、ALDH2、ERBB2、ALDH1L1、TF、ALDH8A1),功能富集分析提示DEGs多参与代谢过程,包括三大营养物质(糖类、脂肪、蛋白质)代谢,尤其是脂质代谢,同时与氧化还原生理过程密切相关,其中3个关键基因(CAT、ALDH2、ALDH8A1)与肝癌的生存分析具有紧密联系,可能与NASH发展到HCC密切相关.结论这些筛选出来的NASH关键基因在未来可能会成为NASH新的诊断生物学标志物或靶向性治疗的目标,为未来本领域的科学探索奠定新的方向.

关键词：非酒精性脂肪性肝炎、差异性表达基因、芯片、蛋白-蛋白相互作用

所属期刊栏目：50

分类号：R575.1(消化系及腹部疾病)

资助基金：陕西省科技攻关计划项目;陕西省普通高等学校优势学科建设项目

在线出版日期：2020-03-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1060-1065