10.15983/j.cnki.jsnu.2017.04.344
丹参WRKY家族成员TRANSPARENT TESTA GLABRA2(TTG2)基因克隆与生物信息学分析
从丹参转录组数据库中克隆得到丹参WRKY家族成员TRANSPARENT TESTA GLABRA2(TTG2)基因(命名为SmTTG2(Genbank注册号: KC161227)),该基因包含一个长为1 425 bp的完整开放读码框,编码475个氨基酸,DNA水平上包含3个内含子.序列分析显示,SmTTG2编码蛋白具有2个WRKY结构域和C2H2结构,属于I类WRKY家族成员,并且与黄瓜、怪柳等物种WRKY44高度相似.软件预测SmTTG2相对分子量为51.28 kDa,等电点为8.58,且其在胞内不稳定,不具跨膜结构.利用DNA步移技术克隆获得SmTTG2基因5′侧翼区序列,分析结果显示该区域除了含有TATA box和CAAT box外,还包含应答环境因子和植物激素的、调节植物发育的顺式作用元件以及MYB转录因子结合位点.实时荧光定量PCR结果表明,SmTTG2基因在丹参花中表达量最高,且随着花期显示出逐步增高的趋势;另外SmTTG2基因的表达伴随丹参种子萌发过程,提示SmTTG2基因可能参与种子的发育和萌发过程.
丹参、SmTTG2、生物信息学分析、表达模式
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Q943.2(植物学)
国家自然科学基金31670299
2017-08-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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