红尾副鳅线粒体基因组序列测定与分析
采用长PCR和嵌套 PCR 相结合的方法测定并注释了红尾副鳅 Paracobitis variegatus （Dabry de Thiersant，1874）线粒体基因组全序列．结果表明：红尾副鳅线粒体基因组全长16571 bp，A＋T含量55．6％，基因构成及排列与其他硬骨鱼基本相同，包含37个基因和1个控制区（D-loop区）．基因组结构紧密，除控制区外基因间仅存在63 bp的间隔，33 bp的重叠．13个蛋白质编码基因中，除了COI基因以GTG作为起始密码子，COII、COIII和Cyt b以不完整的 T，ND4基因以不完整的TA作为终止密码子外，大都以典型的ATG作为起始密码子，以TAA或TAG作为终止密码子．22个tRNA基因的二级结构中，除了 tRNASer（AGN）外，其余21个都可以折叠成典型的三叶草结构，tRNASer（AGN）缺失了DHU臂，在相应位置上只形成一个环．预测了 rRNA的二级结构，其中12S rRNA包含43个茎环结构，16S rRNA包含6个结构域，53个茎环结构．控制区包含1个终止相关序列 TAS1、3个中央保守序列（CSB-F、CSB-D、CSB-E）、2个保守序列区（CSB-2、CSB-3）．
红尾副鳅、线粒体基因组、tRNA二级结构、控制区
Q951(动物学)
国家自然科学基金资助项目31372158；中央高校基本科研业务费专项资金项目GK201002044．
2014-08-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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