丹参赤霉素刺激转录基因SmGAST的克隆及生物信息学分析

摘要：

通过对丹参EST数据库进行BLAST比对,发现一条与GAST基因家族同源性较高的基因序列(CV163373),采用RT-PCR方法从丹参中克隆得到该基因,命名为SmGAST.该基因cDNA序列长406 bp,包含一个303 bp的ORF,编码100个氨基酸残基,推测为GAST基因家族的一个新基因.生物信息学分析表明,SmGAST所编码蛋白的分子量为10.5473 kD,理论等电点为9.01,具有信号肽,为定位于胞外的不稳定类蛋白,具有GAST基因家族所特有的功能结构域.实时定量PCR检测的结果显示,SmGAST在丹参根、茎和叶中均有表达,但主要在叶中表达,茎部的表达量最低.

关键词：丹参、赤霉素刺激转录基因、生物信息学、表达分析

所属期刊栏目：39

分类号：Q945(植物学)

资助基金：国家"十一五"科技支撑计划项目2006BAI06A12-04

在线出版日期：2011-11-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：64-70