猪博卡病毒1型nPCR检测方法的建立与SXWN20株基因序列分析

摘要：

建立了检测猪博卡病毒1型(PBoV)的nPCR方法,对陕西省部分猪群PBoV1型感染情况进行流行病学调查.通过优化反应体系与条件,测试了方法的灵敏性和特异性,建立了 PBoV1型nPCR检测方法,并对阳性样品进行测序分析.结果表明,建立nPCR方法检测PBoV1型单链DNA的极限为4.742×10-2 ng/μL,该方法与PCV2、PCV3、PPV、猪链球菌和猪大肠杆菌DNA均无交叉反应,特异性良好.检测了陕西省猪场60份样品,PBoV1型阳性率为3.33％(2/60).测序获得的SXWN20株VP1/VP2基因序列比对发现,SXWN20株与参比的PBoV1型毒株核苷酸同源性为96.6％～97.5％,与PBoV2/3/4/5型同源性仅为53.8％～59.7％.进化树分析显示,所有参比毒株分为3个大分支,SXWN20株与PBoV1型毒株处在一个进化分支,PBoV2型处在一个进化分支,PBoV3/4/5型处在一个进化分支.

关键词：猪博卡病毒、核酸检测、序列分析、聚合酶链式反应

所属期刊栏目：68

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：陕西省科技计划项目;咸阳职业技术学院科研基金资助项目;陕西省自然科学基金;咸阳市科技计划项目

在线出版日期：2023-01-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：82-86