盘基网柄菌DJ-1基因的克隆及生物信息学分析

摘要：

目的:盘基网柄菌是研究药物作用机理、细胞信号转导和神经退行性病变的模式生物.对盘基网柄菌J-1基因进行克隆和序列分析,可以为研究J-1基因在肿瘤抑制和神经退行性病变中的作用机理奠定基础.方法:以盘基网柄菌总基因组为模板,利用Primer5.0设计特异性引物扩增盘基网柄菌J-1基因,并将扩增的DJ-1基因插入大肠杆菌原核表达质粒pUC18,进行酶切、连接、E.coliDH5α菌株转化和筛选、DJ-1序列测定以及J-1的核苷酸和蛋白质序列分析.结果:盘基网柄菌J-1基因全长618 bp,无内含子,共编码205个氨基酸.在系统发育上与梭菌属形成两个分支,本属内D.discoideum和D.purpureum亲缘关系相近.盘基网柄菌DJ-1蛋白质的分子量约为22.87 kD,其等电点为5.31,含86个非极性氨基酸和119个极性氨基酸,无信号肽识别序列和跨膜结构.DJ-1蛋白质二级结构以α-螺旋、无规卷曲和延伸链为主.Pretotar软件预测DJ-1位于盘基网柄菌细胞内质网上.结论:盘基网柄菌J-1基因与人类DJ-1基因具有高度相似性,对其进行克隆和生物信息学分析可以为今后利用盘基网柄菌模型研究J-1基因的功能和机制提供理论支持.

关键词：盘基网柄菌、DJ-1、克隆、生物信息学

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资助基金：教育部大学生创新训练项目;陕西省教育厅自然科学专项项目

在线出版日期：2020-10-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：18-22,59