玉蜀黍尾孢菌VelB基因敲除及生物信息学分析

摘要：

[目的]通过对玉蜀黍尾孢菌VelB基因进行生物信息学分析并构建敲除载体,为研究CzVelB调控玉蜀黍尾孢菌致病性的分子机制奠定基础.[方法]从JGI数据库中获得CzVelB基因序列,对其进行生物信息学分析,包括蛋白质的性质、保守区域、磷酸化位点、亚细胞定位、跨膜结构域和聚类分析,分析其基因功能.并采用同源互补原理构建CzVelB基因敲除载体,最终采用农杆菌介导遗传转化技术进行基因敲除.[结果]CzVelB基因编码385 AA,预测pI和MW分别为9.05和42.13645 kDa,是亲水性蛋白,无跨膜结构域.在亚细胞水平上,CzVelB定位在细胞核中.在氨基酸序列方面,具有多个丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸激酶磷酸化位点;在功能上具有2个Velevt的保守结构域,并与As?pergillus flavus、A.niger亲缘关系较近,具有较高同源性.根据CzVelB基因序列设计特异性引物,扩增侧翼片段和标记基因,分别连入骨架载体pPZP100中,成功构建CzVelB基因的敲除载体,最终利用ATMT技术获得其敲除转化子.[结论]本文系统研究玉蜀黍尾孢菌VelB基因功能,并成功构建其敲除载体,获得敲除转化子,为后续研究CzVelB基因功能提供基础材料.

关键词：玉蜀黍尾孢菌、VelB、生物信息学、敲除载体、敲除突变体

所属期刊栏目：42

分类号：S432.1(病虫害及其防治)

资助基金：山西省高等学校科技创新项目;山西农业大学科技创新基金项目

在线出版日期：2022-05-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：56-64