谷子ZF?HD基因家族的鉴定及生物信息学分析

摘要：

[目的]ZF?HD是植物特有的一类调节植物生长发育和抗逆性的转录因子.对谷子ZF?HD进行全基因组水平的鉴定和表达分析,旨在为深入探索ZF?HD在谷子中的功能奠定一定的基础.[方法]利用生物信息学鉴定谷子ZF?HD基因家族成员,并对谷子ZF?HD家族成员染色体定位、理化性质、基因结构、蛋白保守结构域、进化关系和表达模式进行分析.[结果]共鉴定到谷子ZF?HD家族基因16个,分布在8条染色体上;进化分析发现谷子ZF?HD家族基因可以分为5个亚类;motif预测共鉴定到4个保守motif基序;顺式作用元件分析发现与干旱响应相关的ZF?HD基因共9个;谷子ZF?HD家族基因与拟南芥中2个基因、水稻中13个基因存在共线性;5个ZF?HD家族基因被预测定位到细胞核内;谷子ZF?HD家族基因在穗中表达最多,干旱胁迫下不同抗旱性品种中ZF?HD基因的表达模式不同,存在时空特异性.[结论]研究结果为深入挖掘该家族基因在谷子生长发育及逆境胁迫中发挥的作用提供理论基础.

关键词：谷子;ZF-HD;生物信息学分析;表达分析

所属期刊栏目：41

分类号：S515(禾谷类作物)

资助基金：国家自然科学基金;山西省重点研发计划项目;山西省青年科技研究基金;山西农大校基金项目;山西农业大学科技创新基金

在线出版日期：2021-12-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：13-25