马身猪ZNF280D基因新型剪接体的鉴定及生物信息学分析

摘要：

[目的]本试验旨在探究马身猪中锌指蛋白(zinc finger protein)ZN F280D基因的剪接体类型.[方法]在猪转录组测序对ZN F280D基因剪切位置预测的基础上,采用RT-PCR和克隆测序技术对预测的剪切位点进行验证,检测该基因不同剪接体的结构并进行生物信息学分析.[结果]共检测到2个剪接体,分别是ZN F280D1和ZN F280D2,ZN F280D1为该基因的常规转录本,ZN F280D2第8外显子5'端大部分缺失.ZN F280D1含有3个C2 H2型锌指结构域,属tC2 H2型锌指蛋白,ZNF280D2含有4个C2 H2型锌指结构域,属maC2 H2型锌指蛋白.[结论]ZN F280D2与DNA的亲和力大于ZN F280D1.

关键词：猪、ZNF280D基因、剪接体

所属期刊栏目：37

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：山西省科技创新重点团队项目201605D131045-24;山西省农业科技攻关项目20140311020-5

在线出版日期：2017-10-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：726-732