百合S-RNase基因cDNA全长克隆及表达分析
[目的]克隆百合S-RNase基因cDNA全长序列并进行表达信息分析,为百合不亲和机制的研究奠定基础.[方法]以东方百合(Lilium oriental)品种''Justina''为材料,通过RACE技术克隆百合S-RNase基因的cDNA全长序列;采用半定量RT-PCR技术对百合同一时期不同器官的S-RNase基因的表达量进行定性分析;并通过NCBI在线工具以及ProtParam、SignalP、MEGA5对其序列进行生物信息学分析.[结果]克隆基因全长为766 bp,开放阅读框为672 bp,推导编码223个氨基酸;其半定量分析显示表达量由高到低的器官依次为花瓣、叶、茎、大量分泌液时的花柱、无分泌液时的花柱、鳞茎.通过生物信息学分析发现,该蛋白为一个不稳定的亲水蛋白、存在信号肽序列,属于分泌型蛋白.具有典型的RNase T2家族蛋白保守结构域特征,二级结构富含环形结构.在已知的S-RNase基因中,与野茶树的亲缘关系最近.[结论]获得百合S-RNase基因cDNA全长序列及在同一时期不同器官的S-RNase基因的表达量.
百合、S-RNase基因、克隆、半定量
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S682.29(观赏园艺(花卉和观赏树木))
北京市教育委员会2015年科技计划面上项目KM201510020011;北京市属高等学校创新团队建设项目IDHT20150503;科技创新服务能力建设-协同创新中心-林果业生态环境功能提升协同创新中心2011协同创新中心市级PXM2017_014207_000043;北京农学院学位与研究生教育改革与发展项目5056516004/026
2017-08-16(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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