线虫非编码基因上游motif的初步分析

摘要：

非编码基因是能产生有功能的RNA而不编码蛋白质的一类特殊序列.通过Northern印迹杂交(Northern blot)方法在线虫体内鉴定了100个非编码RNA,并且预测了这些小RNA上游保守的特征序列,这些序列位于转录的初始区域,很可能与某些蛋白结合调控转录的起始.采用EMSA(Electrophoretic Mobility Shift Assay)凝胶迁移实验方法分析了其中的两类特征序列UM1和UM3,结果表明UM1和UM3都分别能结合蛋白复合物UM1P和UM2P;通过特异性的竞争反应表明,UM3可以竞争UM1的结合部位,使得UM1不能与UM1P结合,相反UM1却不能影响UM3与UM3P的结合.上述结果暗示了UM1与UM3有相似的序列位点A,UM1P可能只识别A位点,而UM3P除了识别A位点还识别UM3其他的位点.这与预测结果是一致的,UM1与UM3有相似的位点TGTCTG.这些特征序列与蛋白复合物结合的特异性暗示了它们可能是启动子区域与转录因子,该分析结果为研究线虫非编码RNA的转录调控提供了一定的依据.

关键词：非编码基因、凝胶迁移、蛋白

所属期刊栏目：35

分类号：S831.2(家禽)

资助基金：国家自然科学基金项目30630040

在线出版日期：2015-04-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1-5