芸薹属AC亚基因组中P5CR基因家族鉴定与生物信息学分析

摘要：

P5CR基因是广泛存在于生物中的管家基因,对生物响应逆境应答起着非常重要的作用.以拟南芥P5CR基因(AT5G14800.1)的CDS序列为种子序列,鉴定了芸薹属A(白菜组)、C(甘蓝组)亚基因组P5CR基因家族,并进行生物信息分析.共鉴定到8个P5CR基因,都由7个外显子组成,氨基酸数目为276～440个,均为稳定蛋白,亚细胞定位分析发现均分布于细胞质中.α-螺旋和无规则卷曲为主要二级结构元件,以丝氨酸和苏氨酸蛋白磷酸化为主.启动子区最多的顺式作用元件为光响应元件,其次为茉莉酸甲酯反应元件.系统发育将其分为三大亚类,其中亲缘关系最近的为白菜的Bol034305与甘蓝型油菜的GSBRNA2 T00140419001.保守结构域长约105个氨基酸,为高度保守motif.研究结果表明芸薹属AC亚基因组中的P5CR为高度保守蛋白,可能涉及多个响应元件的调节.

关键词：芸薹属、AC亚基因组、P5CR、生物信息

所属期刊栏目：38

分类号：Q754(分子遗传学)

资助基金：陕西省重点研发计划项目;陕西理工大学人才启动项目;陕西省农业厅科技项目

在线出版日期：2022-05-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：49-57