SNR快速算法及基因阈值确定

摘要：

在很长的DNA序列中,DFT的大量运算会影响基因识别的效率,对此提出了在Voss映射下仅依赖于碱基在三种不同位置上出现频率的信噪比计算公式,推导发现在Voss与Z-curve映射下其频谱之间存在4倍缩放关系,仿真实验验证了此结果.针对阈值判别的主观性和经验性等缺陷,运用仿真实验方法确定不同类基因的阈值.从敏感性、特异性和精确度三方面对不同阈值下的测试结果进行了评估.同时提出了基于Bootstrap重复抽样的基因最优阈值算法,对不同类基因的最优阈值进行了预测,其中人和鼠类的最优阈值为1.930,并分析了算法的有效性和可行性,其精确度达到了92.8％.

关键词：基因识别、信噪比、阈值、Bootstrap重复抽样

所属期刊栏目：43

分类号：TP3;R71

在线出版日期：2013-12-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：114-122