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基于结构矩阵的DNA序列的相似性模型

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通过一维映射把DNA序列转化为时间序列,即把数字1,2,3,4分别分配给组成DNA序列的核苷酸A,T,G,C,用时间序列的结构矩阵来描述DNA序列的结构特征,并根据结构矩阵的一些性质定义了结构矩阵的相似性度量,进而利用结构矩阵之间的相似性度量构建了比较DNA序列的相似性模型,以9个不同物种的β-球蛋白基因的第一个外显子(表1)为例验证了该模型的适用性.并得到了较好得结果.

DNA序列、时间序列、结构矩阵、相似性度量

40

R5 ;R3

辽宁省教育厅计划项目2009A125

2011-05-16(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共8页

134-141

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