文蛤MmASS基因克隆及生物信息学分析

摘要：

利用RACE技术克隆获得文蛤精氨酸琥珀酸合成酶基因(MmASS)的cDNA序列全长,该基因全长为1 588 bp,共编码415 个氨基酸,分子量为46.81 kD,理论等电点pI为 5.51.预测蛋白序列包含 6 个保守区域,主要集中了ATP结合位点、天门冬氨酸L-Asp结合位点以及瓜氨酸L-Cit结合位点.氨基酸序列比对结果显示,MmASS蛋白序列的保守功能域与其他物种具有较高的相似度,说明该基因高度保守,可能与其他物种的ASS基因具有相似的功能.系统进化树分析结果表明,MmASS的预测蛋白序列与缢蛏、贻贝、牡蛎等双壳贝类的亲缘关系最近,符合进化规律.亚细胞定位预测结果显示,MmASS定位于细胞质的可能性最大.MmASS不同组织的表达特征结果显示,该基因在各个组织中广泛存在,在文蛤鳃组织中的表达量最高(P＜0.05),其次是肝胰腺组织,由此推测MmASS参与调节文蛤各个组织的生理活动,可能在文蛤的免疫防御机制中发挥重要功能.

关键词：文蛤、ASS、基因克隆、生物信息学分析

所属期刊栏目：21

分类号：Q785(基因工程（遗传工程）)

资助基金：南通市科技局基础科学研究项目;江苏省种业振兴揭榜挂帅项目;水产良种保种及更新项目;水产良种保种及更新项目;江苏省农业自主创新项目

在线出版日期：2023-09-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：187-194