陆地棉类谷氧还蛋(GhGRL)基因家族生物信息学分析

摘要：

谷氧还蛋白(glutaredoxin,GRX)是一类小分子氧化还原蛋白,可以调节蛋白质的氧化还原状态从而维持蛋白质的功能,在生物的生长发育及抗氧化反应中起着重要的作用.类谷氧还蛋白蛋白(glutaredoxin-like,GRL)是新划分的GRX类型,本研究为深入探究GRL基因家族在陆地棉中功能,对GhGRL基因家族进行生物信息学及表达分析.研究结果表明,32个Gh-GRL基因主要定位于细胞核,它们均具有GRX-GRX-Like保守结构域.GhGRL基因所编码的氨基酸的多重序列比对和保守序列分析发现,该家族成员序列相似性约为31.31％,大部分包含4个保守基序,同时这4个保守基序与保守结构域重叠;根据GhGRL基因的系统进化树可将32个GhGRL基因分为3亚组,基因结构分析发现该家族基因大部分无内含子;染色体定位分析显示GhGRL基因分散在19个染色体上,每条染色体上的GhGRL基因数目有很大的差别;表达谱数据分析表明,大部分Gh-GRL基因在根、茎、雄蕊、雌蕊、子房、叶片和花等7个组织器官中均有表达,并且有差异.以上结果有利于了解棉花GhGRL基因家族的基本情况,为深入研究该基因家族在生物学功能提供基础.

关键词：陆地棉、类谷氧还蛋白基因、生物信息学、表达谱

所属期刊栏目：19

分类号：Q343.1(遗传学分支学科)

资助基金：国家自然科学基金No.31860395

在线出版日期：2021-07-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：105-114