基于生物信息学筛选染料木素抗骨肉瘤靶基因
染料木素是一种天然的小分子物质,在多种肿瘤中显示出抗肿瘤作用,探究染料木素作用于骨肉瘤的靶基因.从DrugBank下载与染料木素有关的靶基因,分别导入string数据库中进行分析,用Cytoscape作出蛋白质相互作用(PPI)网络,同时用插件Cytohubb分析PPI,获得25个关键基因,再用WebGestalt分析25个基因的KEGG通路,选取与骨肉瘤相关通路的靶基因,得到的靶基因用HCMDB数据库验证,最后用miRDB预测靶基因的miRNA并在GSE65071数据库中进行验证.一共筛选出13个与染料木素有关的靶基因,选择其中药理作用不明的11个基因进行后续分析,string数据库中获得284个与11个靶基因有关的基因,使用WebGestalt分析25个关键基因,随后选取NF-kappa B和Rap1信号通路的靶基因在HCMDB数据库中进行验证,最后使用miRDB和GES65071数据库得到hsa?miR?23b?3p,hsa?miR?23a?3p,hsa?miR?141?3p和hsa?miR?200a?3p.研究显示CXCL8,CXCL12,LPAR1和CNR1;hsa?miR?23b?3p,hsa?miR?23a?3p,hsa?miR?141?3p和hsa?miR?200a?3p可能成为骨肉瘤的治疗靶基因.
染料木素、骨肉瘤、生物信息学、靶基因
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R738.1(肿瘤学)
2021-04-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
47-54
