第二、三代基因组测序数据混合拼接软件综述

摘要：

DNA测序是生物信息学研究的重要内容之一,对测序序列的从头拼接是其中非常基础而重要的步骤.随着测序技术的不断更新,新的第三代测序数据拥有更长的序列长度、高错误率等性质,针对这些性质,同时使用二代、三代测序数据进行混合拼接是获得更好的拼接结果一种重要方式.本文介绍了现有的混合拼接软件的基本原理,并比较了不同软件拼接结果.最后,本文对选择拼接软件以及提出新的混合拼接方法的研究方向给出了建议.

关键词：生物信息学、全基因组序列拼接、第三代测序技术、混合拼接

所属期刊栏目：19

分类号：TP391;TP301.6(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金;国家重点研发项目

在线出版日期：2021-04-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：26-34