MutPrimerDesign:用于人类基因编码区域突变位点的引物设计程序

摘要：

位于基因编码区的DNA突变与基因的功能密切相关.在已知人类基因编码区的突变位点时,如何在基因组上设计引物验证该突变是一个重要的问题.本文利用Python语言开发了引物设计程序MutPrimerDesign.MutPrimerDesign通过解析人类基因组序列数据库以及基因注释信息,转换基因编码区坐标为基因组坐标,并调用Primer3的python程序包接口,可批量自动化完成基因突变位点的引物及探针序列设计.MutPrimerDesign使用简便,可识别多种数据库的基因名称,并能够修改引物常规参数,实现引物的快速调整.

关键词：引物设计、突变、生物信息学分析

所属期刊栏目：18

分类号：Q344.12(遗传学分支学科)

资助基金：中国医学科学院医学与健康科技创新工程No.2017-I2M-1-009

在线出版日期：2021-02-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：169-175