生物信息学方法筛选胶质母细胞瘤的核心基因
多形性胶质母细胞瘤(GBM)是成人最常见的恶性神经上皮肿瘤,关于其诊断和治疗的靶点研究一直是困扰研究者的难题.采用生物信息学的方法对GBM的基因表达信息进行分析,从TCGA中共获取169例GBM样本,正常脑组织样本5例,共17847个基因.筛选出差异基因3184个,利用Gene Ontology(GO)富集分析和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)对差异基因的功能进行富集分析.利用STRING工具和cytoscape构建蛋白互作网络,连通性得分最高的被筛选为核心基因.联合ONCOMINE平台对核心基因进行表达分析.采用Kaplan?Meier法绘制核心基因生存曲线,了解核心基因对GBM患者生存时间和生存几率的相关性.共筛选出上调差异基因1582个,下调差异基因1601个.BottleNeck算法中连通性得分前十被选为核心基因,联合ONCOMINE分析,KCNAB2在GBM中低表达.KCNAB2的过表达预测了GBM患者更短的生存时间.相较于正常脑组织,KCNAB2在GBM中低表达.而当KCNAB2过表达时,GBM患者的生存时间明显缩短.但是,核心基因KCNAB2在GBM患者生存时间中的影响机制和存在价值仍需要进一步的研究去验证.
胶质母细胞瘤、mRNA、核心基因、KCNAB2、生物信息学分析
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S857.14+1(动物医学（兽医学）)
国家自然科学基金项目;广西区自然科学基金项目;中国博士后科学基金项目
2020-04-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
56-64
