文蛤过氧化氢酶的生物信息学分析

摘要：

基于NCBI数据库,对文蛤过氧化氢酶基因(MmeCAT)进行生物信息学分析,旨在为文蛤过氧化氢酶的结构与功能的研究提供理论基础.结果表明,该基因编码511个氨基酸.文蛤过氧化氢酶分子量为58181.29 Da,分子式为C2588 H3928 O767 N730 S20,理论等电点为8.05,属亲水蛋白.带负电荷氨基酸残基数(Asp+Glu)为63个,带正电荷氨基酸残基数(Arg+Lys)为65个.假设所有半胱氨酸全部形成胱氨酸,其消光系数为63175 mol/L,相应的吸光度为1.086;假设所有的半胱氨酸均未形成胱氨酸时,消光系数为62800 mol/L,相应的吸光度为1.079;其半衰期为30 h,脂肪族氨基酸指数为57.28,不稳定系数为27.77(<40),可知文蛤过氧化氢酶为稳定蛋白质.亚细胞定位于过氧化物酶体,存在71个磷酸化位点和51个糖基化位点,无信号肽.二级结构以无规卷曲和α-螺旋为主,在物种进化上具有高度的保守性保守结构域预测表明,该基因编码蛋白可能属于典型单功能过氧化氢酶的第三分支.研究文蛤过氧化氢酶结构,能够为文蛤抗逆性品种选育提供理论基础.

关键词：文蛤、过氧化氢酶、生物信息学分析

所属期刊栏目：17

分类号：Q544+.6(脂类)

资助基金：江苏省渔业科技类重大项目D2018-1;江苏省科技厅苏北专项SZ-YC2018064;江苏省水产三新工程保种项目BZ2018;南通市科技局基础科学研究项目JC2018026

在线出版日期：2019-12-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：249-255