Hsa-miR-10a-5p靶基因预测及生物信息学分析

摘要：

利用生物信息学对miR-10a-5p的靶基因进行预测及相关分析,为miR-10a-5p靶基因的实验验证及其调控机制提供理论基础.通过miRBase获取并分析人、大鼠,小鼠等物种的miR-10a-5p的碱基序列特征;使用在线数据库Targetscan7.1,miRDB,mirDIP和DIANA TOOLS等预测miR-10a-5p的靶基因,并用Venny 2.1绘制韦恩图取交集.用在线工具DAVID对交集靶基因进行GO功能注释和KEGG pathway分析.结果表明miR-10a-5p成熟序列在各物种间高度保守.获得的79个靶基因在分子功能上主要涉及染色质结合,转录活性激活等,并显著富集于肝脏发育,脂肪组织发育等生物学过程,涉及cAMP信号通路,TNF信号通路及AMPK信号通路.miR-10a-5p通过调控靶基因参与了生命活动和疾病过程中多个方面,尤其生长发育和癌症过程,为进一步研究提供了生物学基础.

关键词：miR-10a-5p、靶基因预测、生物信息学

所属期刊栏目：17

分类号：Q343.1(遗传学分支学科)

资助基金：国家自然科学基金项目81273026;湖南省自然科学基金项目2017JJ4047;南华大学研究生科学基金项目2018KYY224

在线出版日期：2019-09-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：189-194