基于Hi-c数据的酵母染色体三维结构重构

摘要：

通过染色体交互频率数据(Hi-c)来预测染色体三维空间结构是近年表观遗传研究热点.研究表明染色体三维空间结构在生物基因表达、调控等方面起到重要作用,对其进行三维重构是研究细胞代谢过程的基本途径.针对酵母Hi-c数据在不同染色体所呈现出的统计特征,拟合出每条染色体交互频率数据分布的数学模型,然后利用梯度上升迭代算法预测并重构其三维结构,并给出模型评估指标.实验结果表明,模型具有较高可重复性和预测精确度.

关键词：Hi-c数据、三维结构、梯度上升算法

所属期刊栏目：17

分类号：S963.32+7(水产养殖技术)

资助基金：国家自然科学基金项目31160234

在线出版日期：2019-09-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：182-188