小儿脓毒症休克相关基因的筛选及网络构建

摘要：

为探究脓毒症休克与SIRS的差异表达基因及网络的构建,筛选潜在的核心基因,从GEO数据库下载相关基因表达谱GSE26378,数据分为脓毒症休克与SIRS各29个样本,通过在线软件GCBI对其进行标准化及差异基因筛选;对差异基因进行GO分析;基于KEGG进行功能通路分析以及基因信号网络分析;差异基因共表达网络分析.结果表明:两组中总共有1456个基因被识别为差异基因(P<0.05),与SIRS组相比,脓毒症休克组中有条859条下调基因,597条上调基因.GO功能富集分析显示差异基因主要参与了细胞周期、细胞免疫、细胞代谢.KEGG功能通路分析显示差异基因主要参与了MAPK信号通路、P53信号通路、wnt信号通路、细胞凋亡信号通路,细胞周期受体信号通路等.共表达分析发现基因CCNB1、NUSAP1、OIP5、SHCBP1、ZWINT、TOP2A、DLGAP5等位于网络中央部位,而基因信号网络分析发现基因PLCB1、PIK3CA、STAT3、CAMK2D、PRKCB、CREB1位于网络核心.基因芯片分析有助于发现脓毒症休克与SIRS患儿外周血单核细胞在转录组学上的改变,而生物信息学网络分析有助于发现潜在的靶点.

关键词：脓毒症休克、SIRS、生物信息学、基因信号网络、基因共表达网络

所属期刊栏目：17

分类号：Q343.1(遗传学分支学科)

在线出版日期：2019-04-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：61-66