Enrich_analysis.pl,差异表达基因富集分析的perl脚本

摘要：

如何从庞大的基因表达数据库里挖掘出有价值的信息,并做出科学的生物学诠释,是基因表达分析领域的重要挑战.富集分析为解决这一问题提出了合理的方案.用Perl语言写了一个脚本——Enrich_analysis.pl,可根据基因注释信息进行基因富集分析,并利用Fisher's Exact Test做检验.富集分析先根据生物学知识将基因归类,然后进行基因差异表达分析,提高数据的可解释性.并利用3篇SCI文章的差异基因数据,对本perl脚本进行了对比测试,证明本perl脚本算法正确可靠.

关键词：Enrich_analysis.pl、perl脚本、富集分析、Fisher-s Exact Test、检验

所属期刊栏目：16

分类号：Q811.4;R857.3(生物工程学(生物技术))

资助基金：山西省主要农作物种质创新与分子育种重点科技创新平台201605D151002;山西省优秀博士来晋工作奖励资金科研项目SXYBKY201738

在线出版日期：2018-10-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：178-183