寿命调控同源蛋白Sch9与S6K1的结构与功能分析

摘要：

芽殖酵母Sch9与哺乳动物S6K1是保守的寿命调控同源蛋白,利用生物信息学手段比较分析了Sch9与S6K1的理化性质、亚细胞定位、信号肽和跨膜区、空间结构、蛋白质相互作用网络、序列同源性及进化关系,以期对Sch9与S6K1的结构功能的深入研究提供线索和基础.结果表明Sch9为酸性稳定性亲水蛋白,而S6K1为酸性不稳定的亲水蛋白,均无信号肽和跨膜区域,两者定位于细胞核的可能性最大.Sch9与S6K1的主要二级结构均为无规卷曲,在进化上相当保守,Sch9属于C2超家族和PKc like超家族,S6K1属于PKc like超家族.Sch9相互作用蛋白主要有Cyr1、Tor1、Tor2、Pkh1/2,而S6K1相互作用蛋白主要有PIK3CA、RHEB、Rps6、RPTOR、mTOR,显示两者的相互作用蛋白保守性也较强.同时,分析显示Sch9与S6K1均具有利于蛋白间相互作用的结构特点,为进一步深入研究Sch9与S6K1的分子功能及调控机制提供了一定的理论参考.

关键词：Sch9、S6K1、生物信息学、结构、功能、相互作用

所属期刊栏目：16

分类号：Q255(细胞生理学)

资助基金：四川省科技厅应用基础研究项目2016JY0113;中国大学生科研训练计划项目201710613066

在线出版日期：2018-10-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：148-155