10.3969/j.issn.1672-5565.201705009
数据挖掘技术分析h MTERF1在胃癌中的表达及预后作用
为了探讨人线粒体转录终止因子1(human mitochondrial transcription termination factor 1,hMTERF1)在胃癌中的表达及预后意义,利用BioGPS数据库分析hMTERF1在正常组织中的表达;利用Oncomine数据库检索关于hMTERF1基因的信息,并对hMTERF1基因在胃癌中的表达进行荟萃分析;利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析hMTERF1表达对不同Lauren分型胃癌患者生存时间的影响.BioGPS数据库显示,hMTERF1在人体正常组织中均有表达,其中在心肌组织、子宫体和骨骼肌组织中含量较高.Oncomine数据库中共收集了946个不同类型的hMTERF1研究结果,其中关于hMTERF1表达有统计学差异的研究结果有152个,hMTERF1表达增高的研究有59个,表达降低的研究有93个.共有20项研究涉及hMTERF1在胃癌组织中和正常组织中的表达,包括798例临床样本,与对照组相比,hMTERF1在胃癌中高表达,且差异具有统计学意义(P=0.003).进一步利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析hMTERF1表达对不同Lauren分型胃癌患者生存时间的影响发现,与hMTERF1高表达组相比,hMTERF1低表达组胃癌患者的累积生存时间增高(P=0.045).在肠型胃癌患者中,hMTERF1高表达胃癌患者的生存时间增高(P=0.028).而在弥漫型胃癌患者中,hMTERF1低表达胃癌患者的生存时间增高(P=0.024).在混合型胃癌患者中,hMTERF1高表达患者与低表达患者生存时间的差异无统计学意义(P=0.310).研究表明,大样本数据挖掘能迅速准确地获取胃癌组织中hMTERF1表达的相关信息,为深入研究hMTERF1在胃癌发生发展中的作用奠定基础.
hMTERF1、胃癌、数据挖掘、Oncomine数据库、预后
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R735.2;Q811.4(肿瘤学)
国家自然科学基金81560458, 31601155, 31760331;云南省教育厅科学研究基金项目2016ZDX01,2016ZDX05;云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目2017HB077;大理大学大学生创新创业计划项目X-CXCY-2016-13
2018-01-25(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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