10.3969/j.issn.1672-5565.20161008001
SCOP数据库蛋白质折叠类型的自动分类分析
蛋白质折叠规律研究是生命科学领域重要的前沿课题之一,蛋白质折叠类型分类是折叠规律研究的基础.本研究以SCOP数据库的蛋白质折叠类型分类为基础、以Astral SCOPe 2.05数据库中相似性小于40%的α、β、α+β及α/β类所属的折叠类型为研究对象,完成了989种蛋白质折叠类型的模板构建并形成模板数据库;基于折叠类型设计模板建立了蛋白质折叠类型分类方法,实现了SCOP数据库蛋白质折叠类型的自动化分类.家族模板自洽性检验与独立性检验所得的敏感性、特异性以及MCC的平均值分别为:95.00%、99.99%、0.94与90.00%、99.97%、0.92,折叠类型模板自洽性检验与独立性检验所得的敏感性、特异性以及MCC的平均值分别为:93.71%、99.97%、0.91与86.00%、99.93%、0.87.结果表明:模板设计合理,可有效用于对已知结构的蛋白质进行分类.
折叠设计合理、模板数据库、分类方法
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Q51(蛋白质)
国家自然科学基金21173014;北京市自然科学基金4112010
2017-09-30(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共6页
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